据重庆市卫生健康委员会统计数据显示，重庆市共有36家三级甲等医院，其中主城区域内三级甲等医院共计18家。

重庆主要的三甲医院擅长科室及医院地址：

重庆西南医院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：中医常见病和疑难杂症,泌尿外科疾病,神经外科疾病,感染性疾病,消化内科疾病,检验,骨科疾病,肝胆外科疾病,心血管内科疾病,妇产科疾病,呼吸内科疾病,整形外科,眼科疾病,胸心外科疾病,普通外科疾病,康复理疗,烧伤科疾病

地址：重庆市沙坪坝高滩岩正街30号

重医一院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：麻醉,内分泌疾病,器官移植,肿瘤疾病,心血管疾病,产科疾病,神经内科疾病,神经外科疾病,胸外科疾病,检验,耳鼻喉科疾病,医学影像,呼吸内科疾病,辅助生殖技术,老年疾病,眼科疾病,重症医学,普通外科疾病,无痛技术,微创介入治疗,临床护理,传染病

地址：重庆市渝中区袁家岗友谊路1号

重庆大坪医院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：急危重症,微创介入治疗,严重创伤

地址：重庆市渝中区大坪长江支路10号

重医附二院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：病毒性肝炎,肝病,心律失常,微创外科手术,感染,神经内科疾病,心血管疾病,呼吸内科疾病,肾脏病,肝胆外科疾病,内分泌疾病,老年病,消化内科疾病,神经外科疾病,皮肤病,妇产科疾病,肿瘤疾病,甲状腺乳腺疾病,康复理疗,超声影像学

地址：重庆市渝中区临江路76号

重庆新桥医院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：呼吸内科疾病,心血管内科疾病,心血管外科疾病,骨科疾病,泌尿外科疾病,神经外科疾病,普外科疾病,肝胆外科疾病,胸外科疾病,整形外科

地址：重庆市沙坪坝区新桥正街

重庆儿童医院

类别：三级甲等专科医院

擅长诊治：小儿急救,小儿哮喘,危重新生儿抢救,早产儿的救治,儿童营养咨询,小儿创伤,儿童五官保健,儿童保健与发育行为,小儿康复治疗,小儿危重症

地址：重庆市渝中区中山二路136号

重庆市中医院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：肿瘤疾病,肾病,妇科病,针灸,神经内科疾病,皮肤科疾病

地址：重庆市江北区盘溪支路6号(南桥寺院部)；渝中区道门口40号(南桥寺院部)

重庆市肿瘤医院

类别：三级甲等专科医院

擅长诊治：中医肿瘤,头颈肿瘤,乳腺肿瘤,乳腺疾病,子宫颈癌,肿瘤放射治疗

地址：重庆市肿瘤医院位于沙坪坝区汉渝路181号（石门大桥南桥头）

重庆市第二人民医院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：眼科疾病,全科医学科相关疾病,血液病,骨科疾病

地址：重庆永川市萱花路439号

重庆市涪陵中心医院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：神经外科疾病,肝胆外科疾病

地址：重庆市涪陵区高笋塘路2号

重庆市口腔医院

类别：三级甲等专科医院

擅长诊治：牙体牙髓病,牙周粘膜疾病,口腔颌面外科,口腔修复,口腔正畸,儿童口腔疾病,牙种植

地址：重庆渝中区上清寺路5号

重庆武警医院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：神经内科疾病,优生优育,创伤救治

地址：重庆市南岸区弹子石卫国路90号

重庆市三院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：老年病,耳鼻喉科疾病,眼科疾病,肾内科疾病,普外科疾病,心血管内科疾病,检验,放射诊断

地址：中国重庆渝中区枇巴山正街104号

重庆九院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：全科医疗,儿科疾病,急危重症,儿童孤独症,血液净化,食管疾病,风湿病,情志病

地址：重庆市北碚区嘉陵村69号

重庆三峡中心医院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：治未病,康复医学,神经系统疾病,男科疾病,肛肠病,妇产科疾病,儿科疾病,急诊医学

地址：重庆市万州区新城路165号

重庆市急救医疗中心

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：妇产科疾病,心内科疾病,神经外科疾病,屈光矫正,皮肤性病,创伤急救

地址：重庆市渝中区健康路1号

重庆五院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：脑卒中,小儿哮喘

地址：重庆市南岸区仁济路24号

重庆市江津区中心医院

类别：三级甲等综合医院

擅长诊治：儿科疾病,临床麻醉,呼吸内科疾病,泌尿外科疾病

地址：重庆市江津区鼎山街道办事处江州大道615号

下面是最新重庆主城三甲医院排名前二十名单：

20、重庆武警总队医院

19、重庆市第五人民医院

18、重庆市黔江中心医院

17、重庆三峡中心医院百安分院

16、重庆市第九人民医院

15、重庆市涪陵中心医院

14、重庆市第四人民医院

13、重庆市第三人民医院

12、重庆市第一人民医院

11、重庆三峡中心医院儿童分院

10、重庆市肿瘤医院

9、重庆医科大学附属口腔医院

8、重庆三峡中心医院

7、重庆市中医院

6、重庆医科大学附属第二医院

5、重庆大坪医院

4、重庆医科大学附属第一医院

3、第三军医大学新桥医院

2、重庆医科大学附属儿童医院

1、重庆西南医院